Guido Fist Pump aka the Guido Wikipedia

This is amazing - thanks Steve

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GFP-like fluorescent proteins (FPs) are the key color determinants in reef-building corals (class Anthozoa, order Scleractinia) and are of considerable interest as potential genetically encoded fluorescent labels. Here we report 40 additional members of the GFP family from corals. There are three major paralogous lineages of coral FPs. One of them is retained in all sampled coral families and is responsible for the non-fluorescent purple-blue color, while each of the other two evolved a full complement of typical coral fluorescent colors (cyan, green, and red) and underwent sorting between coral groups. Among the newly cloned proteins are a “chromo-red” color type from Echinopora forskaliana (family Faviidae) and pink chromoprotein from Stylophora pistillata (Pocilloporidae), both evolving independently from the rest of coral chromoproteins. There are several cyan FPs that possess a novel kind of excitation spectrum indicating a neutral chromophore ground state, for which the residue E167 is responsible (numeration according to GFP from A. victoria). The chromoprotein from Acropora millepora is an unusual blue instead of purple, which is due to two mutations: S64C and S183T. We applied a novel probabilistic sampling approach to recreate the common ancestor of all coral FPs as well as the more derived common ancestor of three main fluorescent colors of the Faviina suborder. Both proteins were green such as found elsewhere outside class Anthozoa. Interestingly, a substantial fraction of the all-coral ancestral protein had a chromohore apparently locked in a non-fluorescent neutral state, which may reflect the transitional stage that enabled rapid color diversification early in the history of coral FPs. Our results highlight the extent of convergent or parallel evolution of the color diversity in corals, provide the foundation for experimental studies of evolutionary processes that led to color diversification, and enable a comparative analysis of structural determinants of different colors.

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Shimomura dió el primer paso, pero fue Douglas Prasher en 1987 quien vió el gran uso que se podía sacar de esta proteína y encendió la chispa de la revolución que nos ocupa. Las proteínas no se pueden ver al microscopio, y por lo tanto saber de su localización era imposible, pero ¿que ocurriría si nuestra proteína fluoreciera?, si le añadiéramos la pequeña GFP a nuestra proteína iría con una pequeña linterna, mostrándonos que lugar ocupa en cada momento. Ahora el reto era generar nuestra proteína problema fusionada a la GFP. Para ello habría que incluir su secuencia, justo antes del codon de STOP de la anterior proteína, y rezar para que saliera un TODO, que la "cola" que le añadíamos no interfiriera, y que por supuesto fluoreciera tras irradiarla con luz azul...y aunque era complicado el reto salió adelante.

En 1992 en el National Cancer Institute Prasher consiguió clonar la GFP en bacterias, y quería introducirla como marcador para células tumorales, pero su financiación era limitada (así es la ciencia amigos) y tuvo que ceder el relevo a Marty Chalfie, de la universidad de Columbia. Marty, con las manos de Ghia Euschirken y la GFP de Prasher, consiguió introducir el gen en E.Coli y sacar la siguiente foto en un Science de 1994:

En la foto se ve una placa de cultivo, donde las bacterias de la derecha tienen el gen de la GFP.

Pensaréis que la historia sigue con nuevas y más aplicaciones de la GFP, y estaréis en lo cierto. Pero nos faltan compañeras de viaje. Sergey A.Lukyanov dedicó gran parte de su investigación a encontrar otras proteínas similares, y las encontró, como a Aquarea, en el mar. En los corales (que no fluorecen) estaban escondidas la DsRed (adivinad el color) y Katuska ( por las manitas que la descubrieron de Ekatrina Merzlyak) que emite en el rojo lejano. Así llegamos al año 2007.

Ya sólo nos queda presentar a Roger Tsien, científico al que debemos el estudio de distintas mutaciones de la GFP, que nos han dado una inmensa variedad de emisiones en distintas longitudes de onda, si necesitáis verlas, observad:

Es difícil de imaginar la cantidad de descubrimientos que se le deben a esta tecnología. Ahora podemos ver proteínas, podemos seguirlas en los distintos órganos, o ver cómo se regula su expresión. También se han puesto a punto sofisticados métodos de transmisión de energía entre fluoróforos, de forma que podamos estudiar si dos proteínas se unen directamente o no. También podemos insertarla en el genoma de virus para seguirlos, o diferenciar mutantes a los que acompañamos la mutación o el gen nuevo de la GFP.

Actualmente con la luciferasa son los marcadores por excelencia, y cuesta pensar muchos experimentos, sin contar con ellos...

Os dejo con un bonito cuadro, pintado con bacterias que expresan distintos tipos de GFP y un ejercicio, encuentra al ratón transgénico...

Nota: Las fotos se han sacado del website oficial de la GFP (http://www.conncoll.edu) , wikipedia y de búsquedas en google images.

なんでも昨年ニューヨークで発表された新作だそうで、私の個人的な感想を徒然と。

まず、展示されていたものを個人で描かれているのは素直に驚きました。

近づいてみたり、遠くから見たりして思ったのが、滝のような流線形ではないが、神経細胞をGFPで染色した時に観察されるようなイメージが浮かびました。

あと、滝なので、人間の目線以外に、滝上から見下げてみたり、滝下から見上げてみたり出来ないかなあと思いました(流石に会場で寝そべることは出来ませんでした)。

人がいっぱいいると、百貨店てどうも苦手なんだけど、朝早くに行ったし、客の混み具合はさほどなかったので、ゆっくり百貨店の中を回って、いろいろ観察できたのは良かったです。って基本的には楽しいとこだと思うよ。

参考

• 千住博展ハルカナルアオイヒカリ